Конфлікт інтересів виникає тоді, коли фінансові, професійні, особисті чи інші обставини можуть вплинути (або можуть сприйматися як такі, що впливають) на об'єктивність підготовки, рецензування або публікації наукової праці. Прозоре розкриття таких обставин є обов'язковою умовою співпраці з European Journal of Interdisciplinary Issues і відповідає рекомендаціям COPE та ICMJE.

Автори зобов'язані розкрити всі потенційні конфлікти інтересів — як фінансові (гранти, стипендії, гонорари, патенти, консультаційні угоди, участь у капіталі, оплата за підготовку матеріалу), так і нефінансові (особисті, академічні чи політичні зв'язки, членство в організаціях, конкуруючі наукові позиції). У статті обов'язково зазначаються джерела фінансування дослідження та роль спонсорів. Якщо конфлікту інтересів немає, автори вміщують відповідну заяву: «Автори заявляють про відсутність конфлікту інтересів».

Рецензенти повинні відмовитися від рецензування рукопису, якщо мають конфлікт інтересів щодо його авторів, змісту чи джерел фінансування, або якщо не можуть забезпечити неупередженість оцінювання. Інформацію, отриману під час рецензування, заборонено використовувати задля власної вигоди.

Редактори та члени редакційної колегії не беруть участі в ухваленні рішень щодо рукописів, з якими мають конфлікт інтересів (зокрема щодо власних праць чи праць близьких колег і співавторів); у таких випадках розгляд передається іншому редакторові. Рішення про публікацію ґрунтується виключно на науковій якості, оригінальності та відповідності тематиці журналу, а не на комерційних чи особистих інтересах.

Нерозкритий конфлікт інтересів, виявлений після публікації, розглядається як порушення видавничої етики та може мати наслідком публікацію уточнення або відкликання статті.